החל מיום ה-30.05.2017, על כל אזרח ישראלי החובה להיות לחלק מן המאגר הביומטרי. לאחר ארבע שנים ומגוון הליכי חקיקה מורכבים יותר ופחות, תוך כדי מאבקים מצד מתנגדים רבים, כל אזרח אשר מעוניין להוציא דרכון או תעודת זהות חדשים מחויב להצטרף למאגר. 

אזרח אשר מעוניין להצטרף למאגר הביומטרי יתבקש לספק טביעות של שתי אצבעות מורות, בנוסף לצילום פניו באיכות גבוהה. אם יסרב לכך, תעודת הזהות שלו תזכה לתוקף של חמש שנים ולא לעשר במידה ויסכים.

אם ביקשתם להנפיק תעודת זהות רגילה, ללא אמצעים ביומטריים טרם כניסת החובה, תוקפה יהיה לעשר שנים. כלומר תעודת זהות אשר הונפקה עד המועד הקובע, תקפה עד לשנת 2027.

על פי תקנות החוק הביומטרי החדשות, קיימת חובה להסביר לאזרחים כי אינם מחויבים למסור טביעות אצבע.

לשכת האוכלוסין תבצע הסברה מקיפה וכן הצגת סרטוני הדרכה לצד חלוקת עלונים. בנוסף לכך, באתר רשות האוכלוסין מצויים הסברים בנושא המאגר בשש שפות: צרפתית, אמהרית, ערבית, עברית, רוסית ואנגלית.

עיקר הוויכוח בנוגע לצורך במסמכים זיהוי ביומטריים נעוץ בשאלת קלות זיופם. לפני מספר חודשיים הגישה התנועה לזכויות דיגיטליות עתירה לבג"ץ כנגד הקמתו של המאגר בתואנה כי "לא נמצא ולו מקרה בודד בו התקיים התרחיש התיאורטי אותו המאגר אמור למנוע".